Postingan

TUGAS REKGEN jurnal tanaman transgenik

Analisis Molekuler Gen Partenokarpi DefH9-RI-iaaM pada Progeni Tomat Transgenik (Molecular Anaysis of DefH9-RI-iaaM Parthenocarpic Gene in Transgenic Tomato Progenies) Metode yang digunakan dalam penelitian tersebut yaitu: 1.       Analisis Molekuler, Uji Ekspresi, dan Uji Fenotipik Gen DefH9-RI-iaaM pada                  Galur Tomat Transgenik T1 Pengambilan sampel dilakukan dengan mengambil daun muda tanaman untuk analisis molekuler. Dari tiap galur tomat transgenik T1 di-sampling sebanyak 10 tanaman untuk analisis molekuler. 2.       Analisis molekuler gen DefH9-RI-iaaM pada galur T1 Analisis molekuler dilakukan dengan teknik PCR menggunakan metode Wang et al. (2008). Teknik ini dilakukan dengan tujuan mendeteksi keberadaan gen DefH9-R1-iaaM pada sampel tiga galur tomat transgenik Ekstraksi DNA dilakukan berdasarkan protokol Ext...

TUGAS MATKUL KULTUR JARINGAN

1.        Serum free media merupakan suatu media yang dirancang untuk menumbuhkan jenis sel tertentu atau melakukan aplikasi tertentu dengan tidak adanya suatu serum. Penggunaan serum free media (SFM) merupakan alat penting, yang memungkinkan suatu kultur sel dilakukan dengan seperangkat kondisi yang ditentukan secara garis besar dari veriabel konfounding. 2.        Keuntungan dari menggunakan serum free media (SFM) yaitu : -peningkatan definisi -kinerja yang lebih konsisten -proses pemurnian dan hilir lebih mudah -evaluasi yang tepat dari fungsi seluler -terjadi peningkatan pertumbuhan atau produktifitas -kontrol yang lebih baik atas respon fisiologis -peningkatan deteksi mediator seluler 3. kerugian dari menggunakan serum free media (SFM) yaitu :                     ...

TUGAS REKGEN Restriction Enzymes

Restriction Enzymes Directions: Identify the restriction sites for each of the examples given. Show the cuts , sticky ends or blunt , number of DNA fragments produced and the number of base pairs in each (count the top row). ( If there are three nucleotides on either side of the dash it is a blunt cut. If there are fewer than three bases on either side of the dash it produces “sticky ends” cut.) Remember:   Analyze in the 5’ à 3’ direction 1.   Hind III --- 5' GTC ↓ GAC 3' 5' ACGACGTA GTC ↓ GAC TTATTAT GTC ↓ GAC CCGCCGCGT GTC ↓ GAC CATCA 3' 3' TGCTGCAT CAG ↓ CTG AATAATA CAG ↓ CTG GGCGGCGCA CAG ↓ CTG GTAGT 5' Tipe pemotongan ujung tumpul ( Blunt ends ), jumlah hasil pemotongan fragmen DNA sebanyak 4. Jumlah pasangan basa nitrogennya adalah 11 bp, 13 bp, 15 bp, dan 8 bp. 2.   Eco RI --- 5' G ↓ AATTC 3' 5' ACG ACGTATTA G ↓ AATTC TTAT CCGCCGCCG G ↓ AATTC T CATCA 3' 3' TGC TGCATAAT CTTAA ↓ G AAT...

TUGAS REKGEN Desain Primer

Gambar
Desain primer gen cytochrome oxidase I (COI) pada Ikan Karang anggota Famili Pseudochromidae (DOTTYBACK) untuk identifikasi spesies Langkah pertama yaitu, membuka alamat www.ncbi.nlm.nih.gov kemudian setelah masuk ke halaman NCBI akan muncul kolom pencarian. Pada kolom tersebut diubah dalam pencarian Gene, kemudian diketik gen yang akan dicari yaitu gen COI. Kemudian setelah diketik gen yang akan dicari yaitu gen COI maka akan muncul berbagai jenis nama gen COI, kemudian di klik gen target. Karena dalam desain primer gen yang dipakai yaitu pada anggota ikan maka di klik COI cytochrome c oxsidase subunit 1 [ Acanthurus lineatus (lined surgeonfish). Setelah di klik gen COI yang sesuai maka akan muncul layar seperti pada gambar diatas, kemudian di klik FASTA.    Setelah klik FASTA maka akan muncul urutan basa nukleotida, kemudian basa nukleotida di block dan di copy-paste di microsoft word kemudian diedit untuk menghilangkan...

TUGAS REKGEN review jurnal

Nama                : Siti Apriliyanti Khodijah   Nanda Dwi Martina Prodi/Kelas      : Biologi/B Tugas Review Jurnal 1.       Optimasi Isolasi DNA Cabai (Capsicum annuum L.) Berdasar Perbedaan Kualitas dan Kuantitas Daun serta Teknik Penggerusan Tahapan isolasi DNA : Isolasi DNA tanaman cabai dilakukan menurut prosedur kit isolasi Plant DNAMITE dari Microzone. Daun digerus dalam mortar dan pelisisan dinding sel dilakukan dengan penambahan buffer LA. Degradasi RNA dilakukan dengan penambahan RNAse, kemudian diinkubasi 10 menit pada suhu ruang. Ekstraksi DNA dilakukan dengan buffer PA dan disentrifugasi 10.000 rpm selama 5 menit. Supernatan yang mengandung DNA dimurnikan dengan buffer CA, diinkubasi selama 10 menit pada suhu ruang, dan disentrifugasi 12.000 rpm selama 10 menit. Supernatan dibuang, pelet yang masih berwarna hijau dilarutkan dalam buff...